تمتاز مديرية جوبا بموقع جغرافي جيد على الضفة الغربية لبحر الجبل. وتمثل النهاية الجنوبية للملاحة النهرية، كما أنها مركز للطرق البرية التي تربطها مع مديريتها، ومديريات أعالي النيل وبحر الغزال، وهي نقطة التقاء الطريق النهرية بالطرق البرية في الإقليم.
وقد اختيرت جوبا كعاصمة للمديرية الإستوائية في عام 1930 نظرا لجودة موضعها حيث ترتفع الأرض وتتجه في انحدارها نحو بحر الجبل.. كما أنها تمثل موضعا جافا يصلح لقيام المباني المستديمة التي تتطلبها مقومات المدينة، وهذا الموضع الممتاز يمثل حماية طبيعته من فيضان بحر الجبل في هذه المنطقة، كما يساعد على تقليل نسبة الرطوبة.
التسميات
السودان