تقدم كلية الآداب والعلوم بجامعة زايد برامج الدراسات العليا التالية للتخرج بدرجة ماجستير كما يلي:
- ماجستير التربية في القيادة التربوية.
- ماجستير التربية في التربية الخاصة.
- ماجستير العلوم في تطوير التعليم والتعلم.
- الماجستير التنفيذي في إدارة الرعاية الصحية (بالاشتراك مع كلية علوم الإدارة).
- الماجستير التنفيذي في الإدارة العامة (بالاشتراك مع كلية علوم الإدارة).
- ماجستير آداب في التصميم.